AlexeyAB
2018-08-09 3baf534a2d603f6b20a06ca45c29350e52a859fb
src/gemm.c
@@ -1,10 +1,15 @@
#include "gemm.h"
#include "utils.h"
#include "im2col.h"
#include "cuda.h"
#include <stdlib.h>
#include <stdio.h>
#include <math.h>
#if defined(_OPENMP)
#include <omp.h>
#endif
void gemm_bin(int M, int N, int K, float ALPHA,
        char  *A, int lda,
        float *B, int ldb,
@@ -426,8 +431,7 @@
// http://graphics.stanford.edu/~seander/bithacks.html
// https://stackoverflow.com/questions/17354971/fast-counting-the-number-of-set-bits-in-m128i-register
// 2 x faster than popcnt: https://arxiv.org/pdf/1611.07612.pdf
// https://arxiv.org/pdf/1611.07612.pdf
static inline int popcnt128(__m128i n) {
    const __m128i n_hi = _mm_unpackhi_epi64(n, n);
@@ -442,77 +446,294 @@
    return popcnt128(_mm256_extractf128_si256(n, 0)) + popcnt128(_mm256_extractf128_si256(n, 1));
}
static inline __m256i count256(__m256i v) {
    __m256i lookup =
        _mm256_setr_epi8(0, 1, 1, 2, 1, 2, 2, 3, 1, 2,
            2, 3, 2, 3, 3, 4, 0, 1, 1, 2, 1, 2, 2, 3,
            1, 2, 2, 3, 2, 3, 3, 4);
    __m256i low_mask = _mm256_set1_epi8(0x0f);
    __m256i lo = _mm256_and_si256(v, low_mask);
    __m256i hi = _mm256_and_si256(_mm256_srli_epi32(v, 4), low_mask);
    __m256i popcnt1 = _mm256_shuffle_epi8(lookup, lo);
    __m256i popcnt2 = _mm256_shuffle_epi8(lookup, hi);
    __m256i total = _mm256_add_epi8(popcnt1, popcnt2);
    return _mm256_sad_epu8(total, _mm256_setzero_si256());
}
static inline int popcnt256_custom(__m256i n) {
    __m256i val = count256(n);
    return val.m256i_i64[0] +
    val.m256i_i64[1] +
    val.m256i_i64[2] +
    val.m256i_i64[3];
}
void gemm_nn_custom_bin_mean_transposed(int M, int N, int K, float ALPHA_UNUSED,
    unsigned char *A, int lda,
    unsigned char *B, int ldb,
    float *C, int ldc, float *mean_arr)
{
    __m256i all_1 = _mm256_set1_epi8(255);
    int i, j, k, h;
    int i;
#if defined(_OPENMP)
    static int max_num_threads = 0;
    if (max_num_threads == 0) {
        max_num_threads = omp_get_max_threads();
        omp_set_num_threads(max_num_threads / 2);
    }
#endif
    #pragma omp parallel for
    for (i = 0; i < M; ++i) {   // l.n - filters [16 - 55 - 1024]
    for (i = 0; i < M; ++i)
    {   // l.n - filters [16 - 55 - 1024]
        float mean_val = mean_arr[i];
        int j, k;
        __m256i all_1 = _mm256_set1_epi8(255);
        for (j = 0; j < N; ++j) { // out_h*out_w - one channel output size [169 - 173056]
            int count = 0;
            const int bit_step = 256;
            __m256i count_sum = _mm256_set1_epi8(0);
            for (k = 0; k < K; k += bit_step) {   // l.size*l.size*l.c - one filter size [27 - 9216]
                //__m128i a_bit128 = _mm_loadu_si128((__m128i *)(A + (i*lda + k) / 8));
                //__m128i b_bit128 = _mm_loadu_si128((__m128i *)(B + (j*ldb + k) / 8));
                //__m128i xor128 = _mm_xor_si128(a_bit128, b_bit128);
                //__m128i c_bit128 = _mm_andnot_si128(xor128, all_1);
                //int tmp_count = popcnt128(c_bit128);
                __m256i a_bit256 = _mm256_loadu_si256((__m256i *)(A + (i*lda + k) / 8));
                __m256i b_bit256 = _mm256_loadu_si256((__m256i *)(B + (j*ldb + k) / 8));
                __m256i xor256 = _mm256_xor_si256(a_bit256, b_bit256);
                __m256i c_bit256 = _mm256_andnot_si256(xor256, all_1); //we can do NOT for wegihts once and do not do this NOT
                int tmp_count = popcnt256(c_bit256);
                __m256i xor256 = _mm256_xor_si256(a_bit256, b_bit256);  // xnor = not(xor(a,b))
                __m256i c_bit256 = _mm256_andnot_si256(xor256, all_1);  // can be optimized - we can do other NOT for wegihts once and do not do this NOT
                if (K - k < bit_step)  tmp_count = tmp_count - (bit_step - (K - k));    // remove extra bits
                count += tmp_count;
                count_sum = _mm256_add_epi64(count256(c_bit256), count_sum);    //  Mula’s algorithm
                //count += popcnt256(c_bit256);
                //binary_int64_printf(c_bit64);
                //printf(", count = %d \n\n", tmp_count);
            }
            // count of 1 bits
            count = count_sum.m256i_i64[0] +
                count_sum.m256i_i64[1] +
                count_sum.m256i_i64[2] +
                count_sum.m256i_i64[3];
            int f1 = (K % bit_step == 0) ? 0 : (bit_step - (K % bit_step));
            count = count - f1;    // remove extra bits (from empty space for align only)
            C[i*ldc + j] = (2 * count - K) * mean_val;
        }
    }
}
static inline float im2col_get_pixel(float *im, int height, int width, int channels,
    int row, int col, int channel, int pad)
{
    row -= pad;
    col -= pad;
    if (row < 0 || col < 0 ||
        row >= height || col >= width) return 0;
    return im[col + width*(row + height*channel)];
}
//From Berkeley Vision's Caffe!
//https://github.com/BVLC/caffe/blob/master/LICENSE
void im2col_cpu_custom(float* data_im,
    int channels, int height, int width,
    int ksize, int stride, int pad, float* data_col)
{
    int c, h, w;
    int height_col = (height + 2 * pad - ksize) / stride + 1;
    int width_col = (width + 2 * pad - ksize) / stride + 1;
    int channels_col = channels * ksize * ksize;
    // optimized version
    if (height_col == height && width_col == width && stride == 1 && pad == 1)
    {
        #pragma omp parallel for
        for (c = 0; c < channels_col; ++c) {
            int w_offset = c % ksize;
            int h_offset = (c / ksize) % ksize;
            int c_im = c / ksize / ksize;
            for (h = pad; h < height_col-pad; ++h) {
                for (w = pad; w < width_col-pad-8; w += 8) {
                    int im_row = h_offset + h - pad;
                    int im_col = w_offset + w - pad;
                    int col_index = (c * height_col + h) * width_col + w;
                    //data_col[col_index] = data_im[im_col + width*(im_row + height*c_im)];
                    __m256 src256 = _mm256_loadu_ps((__m256i *)(&data_im[im_col + width*(im_row + height*c_im)]));
                    _mm256_storeu_ps(&data_col[col_index], src256);
                }
                for (; w < width_col - pad; ++w) {
                    int im_row = h_offset + h - pad;
                    int im_col = w_offset + w - pad;
                    int col_index = (c * height_col + h) * width_col + w;
                    data_col[col_index] = data_im[im_col + width*(im_row + height*c_im)];
                }
            }
            {
                w = 0;
                for (h = 0; h < height_col; ++h) {
                    int im_row = h_offset + h;
                    int im_col = w_offset + w;
                    int col_index = (c * height_col + h) * width_col + w;
                    data_col[col_index] = im2col_get_pixel(data_im, height, width, channels,
                        im_row, im_col, c_im, pad);
                }
            }
            {
                w = width_col-1;
                for (h = 0; h < height_col; ++h) {
                    int im_row = h_offset + h;
                    int im_col = w_offset + w;
                    int col_index = (c * height_col + h) * width_col + w;
                    data_col[col_index] = im2col_get_pixel(data_im, height, width, channels,
                        im_row, im_col, c_im, pad);
                }
            }
            {
                h = 0;
                for (w = 0; w < width_col; ++w) {
                    int im_row = h_offset + h;
                    int im_col = w_offset + w;
                    int col_index = (c * height_col + h) * width_col + w;
                    data_col[col_index] = im2col_get_pixel(data_im, height, width, channels,
                            im_row, im_col, c_im, pad);
                }
            }
            {
                h = height_col-1;
                for (w = 0; w < width_col; ++w) {
                    int im_row = h_offset + h;
                    int im_col = w_offset + w;
                    int col_index = (c * height_col + h) * width_col + w;
                    data_col[col_index] = im2col_get_pixel(data_im, height, width, channels,
                        im_row, im_col, c_im, pad);
                }
            }
        }
    }
    else {
        //printf("\n Error: is no non-optimized version \n");
        im2col_cpu(data_im, channels, height, width, ksize, stride, pad, data_col);
    }
}
void activate_array_cpu_custom(float *x, const int n, const ACTIVATION a)
{
    int i;
    if (a == LINEAR)
    {}
    else if (a == LEAKY)
    {
        __m256i all256_sing1 = _mm256_set_epi32(0x80000000, 0x80000000, 0x80000000, 0x80000000, 0x80000000, 0x80000000, 0x80000000, 0x80000000);
        __m256 all256_01 = _mm256_set1_ps(0.1F);
        for (i = 0; i < n; i += 8) {
            //x[i] = (x[i]>0) ? x[i] : .1*x[i];
            __m256 src256 = _mm256_loadu_ps((__m256 *)(&x[i]));
            __m256 mult256 = _mm256_mul_ps((src256), all256_01); // mult * 0.1
            __m256i sign256 = _mm256_and_si256(_mm256_castps_si256(src256), all256_sing1); // check sign in 8 x 32-bit floats
            __m256 result256 = _mm256_blendv_ps(src256, mult256, _mm256_castsi256_ps(sign256)); // (sign>0) ? src : mult;
            _mm256_storeu_ps((__m256 *)(&x[i]), result256);
        }
        for (; i < n; ++i) {
            x[i] = (x[i]>0) ? x[i] : .1*x[i];
        }
    }
    else {
        for (i = 0; i < n; ++i) {
            x[i] = activate(x[i], a);
        }
    }
}
void float_to_bit(float *src, unsigned char *dst, size_t size)
{
    size_t dst_size = size / 8 + 1;
    memset(dst, 0, dst_size);
    size_t i;
    __m128i all128_0 = _mm_set_epi32(0, 0, 0, 0);
    __m256 all256_0 = _mm256_set1_ps(0);
    __m256i bits_asc = _mm256_set_epi32(1, 2, 4, 8, 16, 32, 64, 128);
    //for(i = 0; i < 8; ++i) bits_asc.m256i_i32[i] = 1 << i;
    __m256i all256_sing1 = _mm256_set_epi32(0x80000000, 0x80000000, 0x80000000, 0x80000000, 0x80000000, 0x80000000, 0x80000000, 0x80000000);
    for (i = 0; i < size; i+=8)
    {
        __m256 src256 = _mm256_loadu_ps((__m256i *)(&src[i]));  // load 256 bits
        __m256 result256 = _mm256_cmp_ps(src256, all256_0, _CMP_GT_OS); // compare dst[i] = (float[i] > 0)
        __m256i src256 = _mm256_loadu_si256((__m256i *)(&src[i]));
        __m256i result256 = _mm256_and_si256(src256, all256_sing1); // check sign in 8 x 32-bit floats
        __m256i bits256 = _mm256_castps_si256(result256);       // floats to ints32
        __m256i and256 = _mm256_and_si256(bits256, bits_asc);   // bitwise and
        uint32_t mask = _mm256_movemask_ps(_mm256_castsi256_ps(result256)); // (val >= 0) ? 0 : 1
        mask = ~mask;   // inverse mask,  (val >= 0) ? 1 : 0
        // sum all elements from single and256
        __m128i tmp128 = _mm_hadd_epi32(_mm256_extractf128_si256(and256, 0), _mm256_extractf128_si256(and256, 1));
        tmp128 = _mm_hadd_epi32(tmp128, all128_0);
        tmp128 = _mm_hadd_epi32(tmp128, all128_0);
        dst[i / 8] = tmp128.m128i_i32[0];
        dst[i / 8] = mask;
    }
    // int _mm256_movemask_epi8 (__m256i a)
}
static inline void transpose4x4_SSE(float *A, float *B, const int lda, const int ldb)
{
    __m128 row1 = _mm_load_ps(&A[0 * lda]);
    __m128 row2 = _mm_load_ps(&A[1 * lda]);
    __m128 row3 = _mm_load_ps(&A[2 * lda]);
    __m128 row4 = _mm_load_ps(&A[3 * lda]);
    _MM_TRANSPOSE4_PS(row1, row2, row3, row4);
    _mm_store_ps(&B[0 * ldb], row1);
    _mm_store_ps(&B[1 * ldb], row2);
    _mm_store_ps(&B[2 * ldb], row3);
    _mm_store_ps(&B[3 * ldb], row4);
}
void transpose_block_SSE4x4(float *A, float *B, const int n, const int m,
    const int lda, const int ldb, const int block_size)
{
    int i;
    if (block_size % 4 == 0) {
        #pragma omp parallel for
        for (i = 0; i < n; i += block_size) {
            int j, i2, j2;
            for (j = 0; j < m; j += block_size) {
                int max_i2 = i + block_size < n ? i + block_size : n;
                int max_j2 = j + block_size < m ? j + block_size : m;
                for (i2 = i; i2 < max_i2; i2 += 4) {
                    for (j2 = j; j2 < max_j2; j2 += 4) {
                        transpose4x4_SSE(&A[i2*lda + j2], &B[j2*ldb + i2], lda, ldb);
                    }
                }
            }
        }
    }
    else {
        #pragma omp parallel for
        for (i = 0; i < n; i += block_size) {
            int j, i2, j2;
            for (j = 0; j < m; j += block_size) {
                int max_i2 = i + block_size < n ? i + block_size : n;
                int max_j2 = j + block_size < m ? j + block_size : m;
                for (i2 = i; i2 < max_i2; ++i2) {
                    for (j2 = j; j2 < max_j2; ++j2) {
                        B[j2*ldb + i2] = A[i2*lda + j2];
                    }
                }
            }
        }
    }
}
#else
void gemm_nn(int M, int N, int K, float ALPHA,
@@ -567,6 +788,115 @@
    }
}
//From Berkeley Vision's Caffe!
//https://github.com/BVLC/caffe/blob/master/LICENSE
void im2col_cpu_custom(float* data_im,
    int channels, int height, int width,
    int ksize, int stride, int pad, float* data_col)
{
    int c, h, w;
    int height_col = (height + 2 * pad - ksize) / stride + 1;
    int width_col = (width + 2 * pad - ksize) / stride + 1;
    int channels_col = channels * ksize * ksize;
    // optimized version
    if (height_col == height && width_col == width && stride == 1 && pad == 1)
    {
        #pragma omp parallel for
        for (c = 0; c < channels_col; ++c) {
            int w_offset = c % ksize;
            int h_offset = (c / ksize) % ksize;
            int c_im = c / ksize / ksize;
            for (h = pad; h < height_col - pad; ++h) {
                for (w = pad; w < width_col - pad; ++w) {
                    int im_row = h_offset + h - pad;
                    int im_col = w_offset + w - pad;
                    int col_index = (c * height_col + h) * width_col + w;
                    data_col[col_index] = data_im[im_col + width*(im_row + height*c_im)];
    }
                for (; w < width_col - pad; ++w) {
                    int im_row = h_offset + h - pad;
                    int im_col = w_offset + w - pad;
                    int col_index = (c * height_col + h) * width_col + w;
                    data_col[col_index] = data_im[im_col + width*(im_row + height*c_im)];
                }
}
            {
                w = 0;
                for (h = 0; h < height_col; ++h) {
                    int im_row = h_offset + h;
                    int im_col = w_offset + w;
                    int col_index = (c * height_col + h) * width_col + w;
                    data_col[col_index] = im2col_get_pixel(data_im, height, width, channels,
                        im_row, im_col, c_im, pad);
                }
            }
            {
                w = width_col - 1;
                for (h = 0; h < height_col; ++h) {
                    int im_row = h_offset + h;
                    int im_col = w_offset + w;
                    int col_index = (c * height_col + h) * width_col + w;
                    data_col[col_index] = im2col_get_pixel(data_im, height, width, channels,
                        im_row, im_col, c_im, pad);
                }
            }
            {
                h = 0;
                for (w = 0; w < width_col; ++w) {
                    int im_row = h_offset + h;
                    int im_col = w_offset + w;
                    int col_index = (c * height_col + h) * width_col + w;
                    data_col[col_index] = im2col_get_pixel(data_im, height, width, channels,
                        im_row, im_col, c_im, pad);
                }
            }
            {
                h = height_col - 1;
                for (w = 0; w < width_col; ++w) {
                    int im_row = h_offset + h;
                    int im_col = w_offset + w;
                    int col_index = (c * height_col + h) * width_col + w;
                    data_col[col_index] = im2col_get_pixel(data_im, height, width, channels,
                        im_row, im_col, c_im, pad);
                }
            }
        }
    }
    else {
        //printf("\n Error: is no non-optimized version \n");
        im2col_cpu(data_im, channels, height, width, ksize, stride, pad, data_col);
    }
}
void activate_array_cpu_custom(float *x, const int n, const ACTIVATION a)
{
    int i;
    if (a == LINEAR)
    {
    }
    else if (a == LEAKY)
    {
        for (i = 0; i < n; ++i) {
            x[i] = (x[i]>0) ? x[i] : .1*x[i];
        }
    }
    else {
        for (i = 0; i < n; ++i) {
            x[i] = activate(x[i], a);
        }
    }
}
void float_to_bit(float *src, unsigned char *dst, size_t size)
{
    size_t dst_size = size / 8 + 1;
@@ -596,6 +926,36 @@
    }
    free(byte_arr);
}
static inline void transpose_scalar_block(float *A, float *B, const int lda, const int ldb, const int block_size)
{
    int i, j;
    //#pragma omp parallel for
    for (i = 0; i<block_size; i++) {
        for (j = 0; j<block_size; j++) {
            B[j*ldb + i] = A[i*lda + j];
        }
    }
}
void transpose_block_SSE4x4(float *A, float *B, const int n, const int m,
    const int lda, const int ldb, const int block_size)
{
    int i;
    #pragma omp parallel for
    for (i = 0; i < n; i += block_size) {
        int j, i2, j2;
        for (j = 0; j < m; j += block_size) {
            int max_i2 = i + block_size < n ? i + block_size : n;
            int max_j2 = j + block_size < m ? j + block_size : m;
            for (i2 = i; i2 < max_i2; ++i2) {
                for (j2 = j; j2 < max_j2; ++j2) {
                    B[j2*ldb + i2] = A[i2*lda + j2];
                }
                }
            }
        }
}
#endif    // __x86_64
void gemm_nt(int M, int N, int K, float ALPHA,