Fixed fread() for net->seen

AlexeyAB

2017-10-21 ae74d0ef31485f84e1856b4733135d2753dbb033

 src/tree.c

@@ -2,6 +2,53 @@
#include <stdlib.h>
#include "tree.h"
#include "utils.h"
#include "data.h"

void change_leaves(tree *t, char *leaf_list)
{
    list *llist = get_paths(leaf_list);
    char **leaves = (char **)list_to_array(llist);
    int n = llist->size;
    int i,j;
    int found = 0;
    for(i = 0; i < t->n; ++i){
        t->leaf[i] = 0;
        for(j = 0; j < n; ++j){
            if (0==strcmp(t->name[i], leaves[j])){
                t->leaf[i] = 1;
                ++found;
                break;
            }
        }
    }
    fprintf(stderr, "Found %d leaves.\n", found);
}

float get_hierarchy_probability(float *x, tree *hier, int c)
{
    float p = 1;
    while(c >= 0){
        p = p * x[c];
        c = hier->parent[c];
    }
    return p;
}

void hierarchy_predictions(float *predictions, int n, tree *hier, int only_leaves)
{
    int j;
    for(j = 0; j < n; ++j){
        int parent = hier->parent[j];
        if(parent >= 0){
            predictions[j] *= predictions[parent]; 
        }
    }
    if(only_leaves){
        for(j = 0; j < n; ++j){
            if(!hier->leaf[j]) predictions[j] = 0;
        }
    }
}

tree *read_tree(char *filename)
{
@@ -19,19 +66,26 @@
        sscanf(line, "%s %d", id, &parent);
        t.parent = realloc(t.parent, (n+1)*sizeof(int));
        t.parent[n] = parent;

        t.name = realloc(t.name, (n+1)*sizeof(char *));
        t.name[n] = id;
        if(parent != last_parent){
            ++groups;
            t.group_offset = realloc(t.group_offset, groups * sizeof(int));
            t.group_offset[groups - 1] = n - group_size;
            t.group_size = realloc(t.group_size, groups * sizeof(int));
            t.group_size[groups - 1] = group_size;
            group_size = 0;
            last_parent = parent;
        }
        t.group = realloc(t.group, (n+1)*sizeof(int));
        t.group[n] = groups;
        ++n;
        ++group_size;
    }
    ++groups;
    t.group_offset = realloc(t.group_offset, groups * sizeof(int));
    t.group_offset[groups - 1] = n - group_size;
    t.group_size = realloc(t.group_size, groups * sizeof(int));
    t.group_size[groups - 1] = group_size;
    t.n = n;