adding coco models

Joseph Redmon

2016-09-08 c62b4f35aa2c59d7db0fd177affeed14b1ba4bcb

 src/utils.c

@@ -2,6 +2,7 @@
#include <stdlib.h>
#include <string.h>
#include <math.h>
#include <assert.h>
#include <unistd.h>
#include <float.h>
#include <limits.h>
@@ -137,15 +138,18 @@
char *find_replace(char *str, char *orig, char *rep)
{
    static char buffer[4096];
    static char buffer2[4096];
    static char buffer3[4096];
    char *p;

    if(!(p = strstr(str, orig)))  // Is 'orig' even in 'str'?
        return str;

    strncpy(buffer, str, p-str); // Copy characters from 'str' start to 'orig' st$
    buffer[p-str] = '\0';
    strncpy(buffer2, str, p-str); // Copy characters from 'str' start to 'orig' st$
    buffer2[p-str] = '\0';

    sprintf(buffer+(p-str), "%s%s", rep, p+strlen(orig));
    sprintf(buffer3, "%s%s%s", buffer2, rep, p+strlen(orig));
    sprintf(buffer, "%s", buffer3);

    return buffer;
}
@@ -174,7 +178,8 @@
void error(const char *s)
{
    perror(s);
    exit(0);
    assert(0);
    exit(-1);
}

void malloc_error()
@@ -268,6 +273,42 @@
    return line;
}

int read_int(int fd)
{
    int n = 0;
    int next = read(fd, &n, sizeof(int));
    if(next <= 0) return -1;
    return n;
}

void write_int(int fd, int n)
{
    int next = write(fd, &n, sizeof(int));
    if(next <= 0) error("read failed");
}

int read_all_fail(int fd, char *buffer, size_t bytes)
{
    size_t n = 0;
    while(n < bytes){
        int next = read(fd, buffer + n, bytes-n);
        if(next <= 0) return 1;
        n += next;
    }
    return 0;
}

int write_all_fail(int fd, char *buffer, size_t bytes)
{
    size_t n = 0;
    while(n < bytes){
        size_t next = write(fd, buffer + n, bytes-n);
        if(next <= 0) return 1;
        n += next;
    }
    return 0;
}

void read_all(int fd, char *buffer, size_t bytes)
{
    size_t n = 0;
@@ -373,6 +414,13 @@
    }
}

void print_statistics(float *a, int n)
{
    float m = mean_array(a, n);
    float v = variance_array(a, n);
    printf("MSE: %.6f, Mean: %.6f, Variance: %.6f\n", mse_array(a, n), m, v);
}

float variance_array(float *a, int n)
{
    int i;
@@ -383,6 +431,13 @@
    return variance;
}

int constrain_int(int a, int min, int max)
{
    if (a < min) return min;
    if (a > max) return max;
    return a;
}

float constrain(float min, float max, float a)
{
    if (a < min) return min;
@@ -390,6 +445,14 @@
    return a;
}

float dist_array(float *a, float *b, int n, int sub)
{
    int i;
    float sum = 0;
    for(i = 0; i < n; i += sub) sum += pow(a[i]-b[i], 2);
    return sqrt(sum);
}

float mse_array(float *a, int n)
{
    int i;
@@ -436,6 +499,19 @@
    }
}

int sample_array(float *a, int n)
{
    float sum = sum_array(a, n);
    scale_array(a, n, 1./sum);
    float r = rand_uniform(0, 1);
    int i;
    for(i = 0; i < n; ++i){
        r = r - a[i];
        if (r <= 0) return i;
    }
    return n-1;
}

int max_index(float *a, int n)
{
    if(n <= 0) return -1;
@@ -450,8 +526,18 @@
    return max_i;
}

int rand_int(int min, int max)
{
    if (max < min){
        int s = min;
        min = max;
        max = s;
    }
    int r = (rand()%(max - min + 1)) + min;
    return r;
}

// From http://en.wikipedia.org/wiki/Box%E2%80%93Muller_transform
#define TWO_PI 6.2831853071795864769252866
float rand_normal()
{
    static int haveSpare = 0;
@@ -484,11 +570,35 @@
   }
 */

size_t rand_size_t()
{
    return  ((size_t)(rand()&0xff) << 56) | 
            ((size_t)(rand()&0xff) << 48) |
            ((size_t)(rand()&0xff) << 40) |
            ((size_t)(rand()&0xff) << 32) |
            ((size_t)(rand()&0xff) << 24) |
            ((size_t)(rand()&0xff) << 16) |
            ((size_t)(rand()&0xff) << 8) |
            ((size_t)(rand()&0xff) << 0);
}

float rand_uniform(float min, float max)
{
    if(max < min){
        float swap = min;
        min = max;
        max = swap;
    }
    return ((float)rand()/RAND_MAX * (max - min)) + min;
}

float rand_scale(float s)
{
    float scale = rand_uniform(1, s);
    if(rand()%2) return scale;
    return 1./scale;
}

float **one_hot_encode(float *a, int n, int k)
{
    int i;